#NEXUS BEGIN DATA; DIMENSIONS NTAX=5 NCHAR=716; FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?; MATRIX Nematode_3 TACATTAAAAAGATTGGTTATAATCCTGCAACAGTACCATTTGTTCCAATTTCTGGATGGAATGGTGACAACATGTTAGAACCAAGCACAAATATGGGATGGTACAAAGGTTGGTCCATTGAACGTAAAACCAACAAGACTGAGGGAAAGACTTTGTTACAAGCTTTGGATGCTATGGAGCCTCCATCAAGACCTCTAGATAAACCTCTTCGTTTGCCCCTCCAAGATGTATACAAAATTGGTGGTATGTATT-TGTGTT-ACCTTAATTTTTTTTTTCTAT--ACT-TGCAG-TAACTCTA-G---TCT---AACAGT-ACTTGAATT--AATTTG-AACAACT--GAGTA---TTTTGCTACCAAT-------------CTTTTTTAAGGTATTGGAACAGTACCTGTTGGTAGAGTGGAAACCGGTATCTTGAAACCAGGAATGGTTGTTACATTTGCTCCAGCTAACTTAACTACTGAAGTAAAATCTGTTGAAATGCATCATGAAGCTCTTACAGAAGCTGTACCTGGTGATAATGTTGGTTTCAATGTAAAGAATGTTTCTGTTAAAGTAAGTTC-ATAGCTGTATTAATTTTTAATTTGCA--TGCATTG-GCATCTAGTATAGATT-AAATTCTTTATTTTTT--CCTTT--GTTAGGAATTGCGTCGTGGTTATGTGTGTGGTGACAGCAAGGACACTCCTCCAAAG Nematode_1 TACATTAAGAAGATTGGTTACAATCCTGCAACTGTACCATTTGTTCCAATTTCTGGGTGGAATGGTGACAACATGTT-GAACCAAGCACAAACATGGGATGGTACAAAGGCTGGTCTATTGAACGTAAAGGCAACAAGACTGAGGGAAAGACTTTGTTACAAGCTTTGGATGCTATGGAACCTCCATCAAGACCTCTAGACAAACCTCTTCGTTTGCCCCTCCAAGATGTATACAAAATTGGTGGTATGTATT-GCTGTTAAGTT--AATTTG--TTTTCATT-ACT-TAGTG--TACTCAA-GTCTTCT---AACAATTGCTTGAATT-GAACTG--AATAACT--AAGTAA--TTTTGCTACCAATCTTTC--------TTTTTTTAAGGTATTGGAACAGTACCTGTTGGTAGAGTTGAAACTGGTATCTTGAAACCAGGAATGGTTGTTACATTTGCTCCAGCTAACATAACTACTGAAGTAAAATCTGTTGAAATGCATCATGAAGCTCTTACAGAAGCTGTACCTGGTGATAATGTTGGTTTCAATGTGAAGAATGTTTCAGTTAAAGTAAGTTC-GCAGCTATATGAATTT--AATTTTCA--TATATTGTGAATCTAGCAAAAATT-AAATGG--TGTATTTT-ACCTTT--GTTAGGAATTGCGTCGTGGTTATGTGTGTGGTGACAGCAAAGACTCTCCTCCAAAG Nematode_2 TACATTAAGAAGATTGGTTACAATCCTGCAACTGTACCATTTGTTCCAATTTCTGGGTGGAATGGTGACAACATGTTAGAACCAAGCACAAACATGGGATGGTACAAAGGCTGGTCTATTGAACGTAAAGGCAACAAGACTGAGGGAAAGACTTTGTTACAAGCTTTGGATGCTATGGAACCTCCATCAAGACCTCTAGACAAACCTCTTCGTTTGCCCCTTCAAGATGTATACAAAATTGGTGGTATGTATT-GCTGTTAAGTT--AATTTG--TTTTCTTT-ACT-TAGTG--TACTCAA-ATCTTCT---AACAATTGCTTGAATT-GAACAA--AATAAC----AGTAA--TTTTGCTACCAATCTTTC--------TTTTTTTAAGGTATTGGAACAGTACCTGTTGGTAGAGTTGAAACTGGTATCTTGAAACCAGGAATGGTTGTTACATTTGCTCCAGCTAACATAACTACTGAAGTAAAATCTGTTGAAATGCATCATGAAGCTCTTACAGAAGCTGTACCTGGTGATAATGTTGGTTTCAATGTGAAGAATGTTTCAGTTAAAGTAAGTCT-GCAGCTATATGAATTT--AATTTTCA--TATGTTGTGCTTCTAGCAAAAATT-AAATTG--TGTATTTT-ACCTTT--GTTAGGAATTGCGTCGTGGTTATGTGTGTGGTGACAGCAAAGACTCTCCTCCAAAG Nematode_7 TACATTAAGAAGATTGGTTACAATCCTGCAACAGTACCATTTGTTCCAATTTCTGGGTGGAATGGTGACAACATGTTAGAACCAAGCACAAACATGGGATGGTACAAAGGCTGGTCTATTGAACGCAAAGGCAACAAGACTGAGGGAAAGACTTTGTTACAAGCTTTGGATGCTATGGAGCCTCCATCAAGACCTCTAGACAAACCTCTTCGTTTGCCCCTTCAAGATGTATACAAAATTGGTGGTATGTATTTGCTGTTAAGCTGAAATTTG--TGTTCTTT-ACT-TGGTG--TACTCAA-GT----------------CTTGAATT-AAACTTT-AATAACT--GAGTAA--TTTTGTTACCAATC------------TTTTTTTAAGGTATTGGAACAGTACCTGTTGGTAGAGTTGAAACTGGTATCTTGAAACCAGGAATGGTTGTTACATTTGCTCCAGCTAACATAACTACTGAAGTAAAATCTGTTGAAATGCATCATGAAGCTCTTACAGAAGCTGTACCTGGTGATAATGTTGGTTTCAATGTAAAGAATGTTTCAGTTAAAGTAAGTTC-ACAGCTATATGAATTTT-AATTTCCA--TATATTGTGCATCTAGCAAAAATT-AAATTG--TTTATTTT-ACCTTT--GTTAGGAATTGCGTCGTGGTTATGTGTGTGGTGACAGCAAAGACTCTCCTCCAAA- Nematode_6 TACATTAAGAAGATTGGTTACAATCCTGCAACAGTACCATTTGTTCCAATTTCTGGGTGGAATGGTGACAACATGTTAGAACCAAGCACAAACATGGGATGGTACAAAGGCTGGTCTATTGAACGTAAAGGCAACAAGACTGAGGGAAAGACTTTGTTACAAGCTTTGGATGCTATGGAGCCTCCATCAAGACCTCTAGACAAACCTCTTCGTTTGCCCCTTCAAGATGTATACAAAATTGGTGGTATGTATT-GCTGTTAAGCTGAAGTTTG--TGTTCTTT-ACT-TGGTG--TATTAAA-GTCTTCT---AACAACTGCTTGAATT-AAACTTT-AATAATT--GAGTAA--TTTTGCTACCAATC------------TTTTTTGAAGGTATTGGAACAGTACCTGTTGGTAGAGTTGAAACTGGTATCTTGAAACCAGGAATGGTTGTTACATTTGCTCCAGCTAACATAACTACTGAAGTAAAATCTGTTGAAATGCATCATGAAGCTCTTACAGAAGCTGTACCTGGTGATAATGTTGGTTTCAATGTGAAGAATGTTTCAGTTAAAGTAAGTTT-GCAGCTATATGAATTT--AATTTTCA--TATATTGTGCAACGAGCAAAAATT-AAATTG--TGTATTTT-ATCTTT--CTTAGGAATTGCGCCGTGGTTATGTGTGTGGTGACAGCAAAGACTCTCCTCCTAAG ; END; begin mrbayes; charset exons = 1 - 244 392 - 573 666 - 716; charset introns = 245 - 391 574 - 665; partition exin = 2: exons, introns; end;