#NEXUS
[written Wed Mar 15 15:27:46 PST 2006 by Mesquite  version 1.06 (build g97) at natsoffice/192.168.1.109]

BEGIN TAXA;
	TITLE Untitled_Taxa;
	DIMENSIONS NTAX=15;
	TAXLABELS
		Gonatus_fabricii Gonatopsis_borealis Alluroteuthis_antarcticus Teuthowenia_megalops Joubiniteuthis_sp. Psychroteuthis_glacialis Moroteuthis_knipovitchi Illex_coindetii Metasepia_tullbergi Loliolus_sp. Photololigo_sp. Pterygioteuthis_microlampas Lycoteuthis_lorigera Bathyteuthis_berryi Octopus_ornatus 
	;

END;


BEGIN CHARACTERS;
	TITLE  Untitled_Character_Matrix;
	DIMENSIONS  NCHAR=657;
	FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?;
	MATRIX
	Gonatus_fabricii             ACATTATACTTTATCTTTGGTATTTGAGCAGGCCTGCTAGGGACCTCCCTAAGCCTAATAATTCGAACTGAATTAGGGCAACCTGGCTCTTTACTAAACGACGATCAACTCTATAATGTTGTAGTTACAGCCCATGGATTTATCATAATTTTTTTTCTAGTAATACCTATTATAATTGGTGGATTTGGTAACTGACTTGTCCCCTTAATATTAGGAGCCCCAGACATAGCTTTTCCTCGAATAAATAATATAAGATTTTGACTATTACCCCCTTCCTTAACACTATTGTTAGCTTCCTCAGCCGTTGAAAGAGGGGCAGGGACAGGATGAACAGTGTACCCCCCTCTTTCCAGAAATTTATCTCATGCAGGTCCTTCAGTTGACTTAGCCATTTTTTCTCTACATTTAGCAGGTGTGTCTTCTATTCTAGGGGCCATTAATTTCATTACTACAATTTT{A,C,G}AATATACGATGAGAAGGATTAC{A,C,G}AATAGAACGATTACCTCTCTTTGCTTGATCAGTGTTTATTACCGC{A,G}ATT{C,T}TAT{C,T}AC{C,T}TCTATCTCTCCCTGTTCTAGCCGGAGCTATTAATATATTATTAACTGATCGAAACTTTAATACAACCTTTTTTGACCCAAGGGGAGGAGGGGATCCTATCTTATACCAACACTTATTC

	Gonatopsis_borealis          ACATTATATTTTATCTTTGGTATTTGAGCAGGACTATTAGGGACTTCTCTAAGACTAATAATTCGGACTGAACTAGGGCAACCTGGTTCTCTACTAAATGACGATCAACTTTACAATGTTGTAGTTACAGCCCATGGATTTATTATAATTTTTTTTCTAGTAATACCCATTATAATTGGGGGATTTGGTAATTGACTTGTTCCTTTAATACTAGGAGCTCCAGACATAGCTTTCCCTCGTTTTT{C,T}CAATATAAGATTTTGACTACTACCCCCTTCTTTAACACTACTTTTAGCTTCCTCAGCTGTTGAAAGAGGAGCAGGGACCGGATGAACAGTTTACCCTCCTCTTTCTAGAAATCTATCTCATGCAGGTCCTTCAGTTGACTTAGCCATTTTCTCTCTACA{A,T}TTAGCAGGGGTC{A,T}C{A,C}TTTATTTTAGGTGCCAT{A,T}AAT{A,G,T}TTATTACTACAATCC{G,T}AAATATACGATGAGAAGGGCTACAAATAGAACGACTACCTCTTTTTGCTTGATCTGTATTTATCACCGCAATTTTACTCCTACTATCACTTCCTGTCCTAGCCGGAGCTAT{A,T}ACAATATTACTAACTGACCGAAACTTCAATACAACTTTTTTTGACCCAGAGGGGGAGGTAGACCCTAT{A,T}TTATACCAACACTTATTC

	Alluroteuthis_antarcticus    ACATTATATTTTATCTTTGGCATTTGAGCAGGATTACTTGGGACTTCCCTAAGACTAATAATCCGAACTGAACTAGGACAACCAGGGTCATTACTAAATGACGACCAACTATATAATGTAGTGGTCACAGCCCATGGATTTATTATAATTTTCTTTTTAGTTATACCTATTATAATTGGAGGTTTTGGTAACTGACTAGTACCTTTAATACTAGGCGCCCCAGATATAGCTTTCCCACGAATAAATAACATAAGTTTCTGATTACTGCCCCCATCTCTAACACTTCTGCTAGCTTCTTCAGCCGTTGAAAGAGGAGCTGGGACAGGATGAACAGTTTACCCCCCTCTATCTAGAAATTTATCACACGCTGGTCCCTCGGTAGACTTAGCTATTTTTTCTCTACACTTAGCAGGTGTATCTTCCATTCTAGGAGCAATTAATTTCATCACAACAATTTTAAATATACGGTGGGAAGGGTTACAAATAGAACGATTACCTTTATTTGCCTGATCTGTATTTATTACTGCAATTTTACTACTTCTATCTCTTCCTGTCCTTGCTGGGGCAATTACGATACTTTTAACAGACCGAAATTTCAACACCACCTTTTTTGACCCAAGGGGTGGAGGAGACCCAATTTTATACCAACACTTCTTT

	Teuthowenia_megalops         ---------------------------ACCGG?-TATTAGG-ACATCCTTAAGATTAATAATCCGAACTGAATTAGGACAACCAGGCTCTCTACTAAATGACGACCAACTATACAATGTAGTAGTTACTGCCCATGGGTTTATTATAATTTTTTTCTTAGTTATACCTATTATAATTGGAGGATTTGGAAACTGACTAGTACCACTAATACTAGGAGCCCCAGATATAGCATTCCCACGTATAAATAATATAAGTTTTTGACTTCTACCTCCATCCTTAACACTTCTATTAGCATCCTCAGCTGTTGAAAGGGGAGCTGGAACAGGATGAACAGTATACCCTCCTTTATCTAGAAATTTATCCCATGCAGGTCCCTCTGTTGATTTAGCTATTTTTTCTCTACACCTAGCGGGTGTCTCTTCTATTCTAGGAGCAATTAATTTTATTACAACTATTTTAAACATGCGCTGAGAAGGCTTACAAATAGAACGACTACCTCTTTTTGCTTGATCTGTTTTTATCACCGCGATTTTGCTTCTTCTATCCCTACCAGTTTTAGCCGGTGCTATTACCATACTATTAACTGACCGAAATTTTAACACAACGTTTTTTGATCCTAGAGGGGGAGG----------------------------

	Joubiniteuthis_sp.           -------------------------GAGCGGGACTTCTAGGAACCTCCTTAAGTATAATAATTCGTACTGAGTTAGGCCAACCAGGATCTCTACTC?ATGATGATCAACTTTATAATGTAGTAGTTACTGCCCACGGATTTATTATAATTTTCTTTTTAGTTATACCTATTATAATTGGAGGATTTGGTAACTGATTAGTACCTTTAATACTAGGGGCACC?GACATAGCATTCCCACGAATAAATAATATAAGATTTTGACTACTACCCCCATCTTTAACCTTATTACTTGCTTCCTCGGCTGTAGAGAGAGGGGCCGGAACAGGATGAACTGTCTACCCCCCATTGTCTAGAAATATTTCTCATGCAGGCCCTTCAGTAGATTTAGCTATCTTCTCTCTTCATTTAGCAGGGGTGTCCTCTATTTTAGGAGCAATTAATTTTATTACCACAATCTTAAATATACGATGAGAAGGGTTACAAATAGAACGTCTTCCACTCTTTGTATGATCTGTTTTCATTACTGCAATTTTATTACTTTTATCTCTACCTGTTTTAGCAGGGGCCATTACTATACTTTTAACAGACCGAAATTTTAACACCACTTTTTTTGACCCAAGGGGGGGAGGGG--------------------------

	Psychroteuthis_glacialis     ACTCTATACTTCATCTTCGGGATTTGAGCAGGTTTACTAGGAACTTCCTTAAGTTTAATAATCCGTACTGAACTAGGACAACCAGGCTCATTACTAAATGATGACCAATTATATAATGTTGTTGTAACCGCCCATGGGTTTATTATAATTTTTTTTTTAGTTATACCTATTATAATTGGAGGATTTGGTAACTGATTAGTACCTTTAATATTAGGTGCACCTGATATAGCCTTCCCTCGAATAAATAATATAAGATTTTGATTACTTCCTCCTTCCCTTACATTACTTTTAACTTCATCTGCAGTAGAAAGAGGAGCCGGAACAGGATGAACAGTATACCCTCCTTTATCTAGTAATCTCTCTCATGCAGGTCCATCAGTAGATCTTGCTATTTTTTCTTTACATCTTGCTGGAGTTTCTTCCATCTTAGGTGCAATTAATTTTATTACAACAATCCTAAATATACGTTGAGAAGGGTTACAAATAGAACGTATTTCATTATTTGTATGATCTGTATTTATTACAGCAATTCTACTACTATTATCCCTACCAGTTTTAGCAGGGGCTATTACTATACTATTAACTGACCGAAATTTTAATACTACTTTTTTTGATCCGAGAGGGGGAGGGGATCCTATTCTCTATCAACATTTATTT

	Moroteuthis_knipovitchi      ACATTATACTTTATCTTTGGCATTTGAGCAGGGTTATTAGGAACTTCCTTAAGTCTAATAATCCGTACCGAACTAGGACAACCAGGATCACTACTAAATGATGATCAACTTTACAATGTAGTAGTAACAGCCCATGGGTTTATTATAATTTTTTTTCTAGTTATACCTATTATAATTGGAGGATTTGGTAATTGATTAGTGCCCCTTATACTAGGGGCACCAGATATAGCTTTTCCTCGTATAAATAATATAAGATTTTGACTACTTCCTCCCTCATTAACACTATTATTGACATCTTCAGCAGTAGAAAGAGGAGCAGGGACAGGATGAACAGTTTACCCTCCTTTATCGAGAAATTTATCACATGCAGGACCTTCAGTAGACCTTGCTATTTTTTCTCTCCACTTAGCTGGAATTTCATCTATTTTGGGAGCAATTAATTTCATTACAACAATCCTAAATATACGGTGAGAAGGCTTAGAAATGGAACGTCTTCCTTTATTTGCCTGATCTGTCTTTATTACTGCAATTTTACTCCTTTTATCATTACCTGTTTTAGCTGGAGCCATTACTATATTATTAACAGATCGAAATTTTAATACTACCTTTTTTGACCCGAGGGGAGGAGGAGACCCCATCTTGTATCAACATCTATTC

	Illex_coindetii              --------------------------GACGGGCTA?TTAGGT?CTTCTTT??GC?TATTAATCCGA?CTGA?TTAGGACAACCTGGGTCATTACTAA?TGATGATC?ACTTTACAATGTAGTAGTTACAGCTCATGGATTTATTATAATTTTTTTCATAGTTATACCTATTATAATTGGAGGGTTTGG{C,T}AATTGATTAGTACCCCTAATATTAGGAGCTCCAGATATAGCTTTCCCGCGTATAAATAATATAAGATTTTGATTACTTCCACCATCTTTAACTATATTACTAGCCTCTTCAGCAGTAGAAAGAGGGGCCGGTACAGGTTGAACGGTATACCCTCCCTTATCTAGAAATTTATCTCATGCTGGACCCTCTGTTGATTTAGCTATTTTTTCATTACACCTTGCAGGTGTTTCCTCTATTCTAGGAGCAATTAATTTTATTACAACTATTTTAAATATACGATGAGAAGGTCTCCAAATAGAACGTTTACCTTTATTTGTATGATCTGTATTTATTACTGCTATTTTATTATTATTATCCCTGCCTGTTTTAGCTGGAGCTATTACCATATTACTAACAGATCGAAATTTTAATACCACT?TTT?TGATCCCAGAGGGGGGAGAA--------------------------

	Metasepia_tullbergi          -------------------------TGACAGGTT-TTTAGGTC-TTCACTA?GATTAATTATTCGAAGTGAGCTAGGCAAACCAGGTACATTATTAAATGATGATCAATTATATAATGTAATAGTTACTGCACATGGATTTATTATAATTTTTTTTTTGGTTATACCTATTATAATTGGAGGGTTTGGTAATTGATTAGTACCATTAATATTAGGCGCACCGGATATAGCATTCCCCCGTATAAATAATATAAGCTTTTGATTATTACCTCCTTCATTAACATTATTACTCTCTTCTTCCATTATAGAAAGAGGGGCTGGCACAGGTTGAACAGTCTATCCTCCATTATCAAGTAATTTATCCCATGCAGGACCTTCTGTGGATTTAGCTATTTTCTCTTTACATTTAGCAGGAAT?TCTTCTATT?TAGGAGCTATTAATTTCATCACCACAATTTTAAATATACGATGGGAAGGTTTACAAATAGAACGGCTCCCCTTATTTGTGTGGTCTGTTTTTATTACAGCTATTTTATTATTATTATCACTACCTGTTTTAGCAGGAGCCATTACTATATTATTAACAGATCGAAACTTCAATACTACATTTTTTGATCCCTGTGGGGGAGGAG--------------------------

	Loliolus_sp.                 -------------------------------GTTTAGTAGGTACTTCATTAAGATTAATAATTCGAACAGAACTAGGTAAACCAGGTTCACTATTAAATGATGATCAACTTTATAATGTAGTAGTTACTGCTCATGGTTTTATTATAATTTTTTTTATGGTAATACCAATCATAATTGGAGGTTTTGGTAACTGATTAGTACCTTTAATATTAGGTGCTCCCGATATAGCTTTCCCACGTATAAATAACATAAGATTTTGATTACTTCCCCCATCTTTGACCATACTTTTATCTTCTTCTGCAGTTGAAAGAGGAGCAGGAACTGGATGGACAGTATACCCTCCATTATCTAGTAATTTATCACATGCAGGTCCTTCAGTTGACTTAGCTATT??TTCTCTACACTTAGCTGGAATCTCTTCAATTCTAGGAGCAATTAACTTTATTACAACC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

	Photololigo_sp.              -------------------------TGACAGG?T?AGTCGGT-CTTCATTAAGCTTA-TAATTCGAACAGAATTAGGTAAGCCTGGATCATTACTGAATGATGATCAATTATATAATGTAGTAGTAACTGCTCACGGTTTTATTATAATTTTCTTTATAGTTATACCTATTATAATTGGAGGCTTTGGTAACTGACTTGTACCTATAATACTAGGTGCTCCAGATATAGCTTTCCCCCGTATAAACAATATAAGATTCTGATTACTCCCACCTTCATTGACACTATTATTAGCTTCTTCCGCAGTTGAAAGAGGAGCCGGAACAGGATGAACAGTTTACCCACCATTATCCAGTAATTTATCTCATGCAGGTCCTTCAGTTGATCTAGCTATTTTTTCATTACATTTAGCTGGTATTTCATCCATTCTGGGTGCTATTAACTTCATCACAACTATTATAAATATACGTTGAGAGGGTTTATTAATAGAACGTATATCACTATTTGTATGATCTGTTTTCATTACAGCAATTCTATTACTTCTTTCCCTCCCAGTTCTAGCTGGAGCAATTACTATGCTTTTAACTGACCGAAATTTTAATACTACT?TTTCTGATCCAAGTGGTGGGAGC---------------------------

	Pterygioteuthis_microlampas  -------------------------GGGCTGGTTTGCTTGGAACTTCACTAAGACTTATAATTCGTACAGAATTGGGTCAACCAGGTTCACTTTTAAATGATGATCAACTTTACAATGTAGTTGTAACTGCTCACGGTTTTATTATAATTTTCTTTTTAGTTATACCTATTATAATTGGAGGTTTCGGGAACTGGTTAGTGCCTTTAATGTTAGGTGCACCTGATATAGCCTTCCCTCGAATAAATAATATAAGATTTTGATTATTACCTCCATCCTTAACCCTACTATTA{A,G}CCTCATCCGCTGTTGAAAGGGGGGCTGGTACTGGTTGAACTGTCTATCCTCCCTTATCTAGCAATCTTTCCCATGCTGGTCCTTCGGTAGACTTAGCTATTTTTTCTCTTCATTTAGC{C,T}GGAGTTTCTTCTATTCTAGGGGCTATTAATTTCATTACAACAATTCTCAACATACGATGAGAAGGCTTACAAATGGAGCGACTCCCTCTTTTTGCCTGATCCGTATTTATTACTGCTATTCTATTATTACTTTCCCTCCCTGTTTTAGCAGGAGCTATTACAATACTTCTAACCGACCGAAACTTTAATACAACTTTTTTTGACCCTAGAGGGGGAGGGA--------------------------

	Lycoteuthis_lorigera         ACTTTATATTTTATCTTTGGTATTTGAGCAGGTTTATTAGGTACTTCATTAAGTCTAATAATTCGTACTGAACTAGGTCAACTTGGTTCTCTATTAAATGATGACCAACTATATAATGTTGTAGTCATAGCTCATGGATTTATTATAATTTTCTTCCTATTATTACTTATTATAATTGGAGGATTTGGTAACTGATTAGTTCCTTTAATGTTAGGGGCACCTGATATAGCTTTCCCTCGTATAAATAATATAAGTTTTTGACTTCTTCCTCCATCATTAACTCTACTACTAGCTTCATCAGCCGTTGAAAGAGGAGCAGGAACAGGATGAACTGTCTACCCTCCCTTATCTAGTAATTTATCCCATGCTGGCCCTTCTGTAGACTTGGCTATTTTTTCTCTCCACCTTGCAGGTGTCTCTTCCATTTTAGGAGCTATTAATTTCATTACTACAATTCTAAATATACGATGAGAAGGTTTACAGATGGAGCGATTACCTTTGTTTGTTTGATCAGTTTTTATTACAGCCATCCTTTTACTTTTATCCCTTCCCGTTTTAGCTGGAGCAATTACTATACTTTTAACCGACCGAAACTTTAACACCACCTTCTTTGACCCTAGAGGTGGAGGTGACCCTATTTTATACCAACACTTATTT

	Bathyteuthis_berryi          -------------------------GAGCAGGATTATTAGGTACTTCTTTAAGATTAATAATCCGAACAGAACTAGGACAACCAGGTTCCTTATTAAATGATGACCAACTCTATAATGTAGTTGTTACTGCCCATGGTTTTATTATAATTTTCTTTTTAGTAATACCTATTATAATTGGAGGGTTTGGTAATTGATTAGTCCCTTTAATATTAGGGGCCCCAGATATGGCATTCCCCCGAATAAACAATATAAGATTTTGATTACTTCCTCCCTCATTAACTTTACTCCTAGCTTCTTCAGCTGTGGAAAGGGGAGCAGGAACAGGCTG?ACAGTATACCCTCCTTTATCTAGAAATCTATCCCATGCTGGACCATCAGTAGACTTAGCTATTTTTTCCCTCCATTTAGCCGGAGTTTCTTCTATCTTAGGAGCAATTAATTTTATTACAACAATTTTAAATATACGATGAGAAGGACTACAAATAGAACGACT?CCCCTTTTTGCTTGATCAGTTTTTA?TACTGCAATTCTGCTACTACTTTCCCTTCCTGTCCTAGCTGGGGCAATTACTATACTATTAACCGACCGAAACTTTAATACTACCTTCTTTGACCCCAGAGGAGGAGAGA--------------------------

	Octopus_ornatus              ---------------------------GTCAGGCTTTTAGGT-CTTCTTTAAGATTAATA?TTCGTACTGAACTAGGCCAACCAGGCTCACTCCTCAGTGACGATCAACTTT?CAACGTAATTGTAACTGCACATGCATTTGTAATAATTTTTTTTTTAGTTATACCCGTAATAATTGGAGGATTTGGAAATTGATTAGTCCCTTTAATATTAGGAGCCCCAGATATAGCATTTCCCCGAATAAATAATATAAGTTTCTGACTTCTACCTCCTTCCTTAACCTTATTATTAACTTCAGCAGCTGTTGAAAGAGGAGTAGGAACAGGTTGAACTGTTTACCCTCCTCTATCAAGAAATCTTGCTCATACAGGCCCATCTGTAGATTTAGCAATTTTTTCACTTCATTTAGCTGGAATTTCATCCATCTTAGGAGCTATTAATTTTATTACTACAATTATTAATATACGATGAGAAGGAA?ACAAATAGA??GTCTTCCTT?A???G?ATGATCTG?A?ATA?CACAGCAAGTCACAAACTTGTA?CCAAACCGGTCCTCGCCGGAGCCA-----------------------------------------------------------------------------------------


;



END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
	TYPESET * UNTITLED   =  unord:  1 -  657;

END;

BEGIN MESQUITECHARMODELS;
	ProbModelSet * UNTITLED   =  'Jukes-Cantor':  1 -  657;
END;

Begin MESQUITE;
		MESQUITESCRIPTVERSION 2;
		TITLE AUTO;
		tell ProjectCoordinator;
		getEmployee #mesquite.minimal.ManageTaxa.ManageTaxa;
		tell It;
			setID 0 4264216616160845556;
		endTell;
		getEmployee #mesquite.charMatrices.ManageCharacters.ManageCharacters;
		tell It;
			setID 0 9187709566729480963;
			checksum 0 3708979478;
		endTell;
		getEmployee  #mesquite.charMatrices.BasicDataWindowCoord.BasicDataWindowCoord;
		tell It;
			showDataWindow #9187709566729480963 #mesquite.charMatrices.BasicDataWindowMaker.BasicDataWindowMaker;
			tell It;
				getWindow;
				tell It;
					setSize 420 280;
					setLocation 60 10;
					setFont SanSerif;
					setFontSize 10;
					onInfoBar;
					setExplanationSize 30;
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					getToolPalette;
					tell It;
					endTell;
					setActive;
					setTool mesquite.charMatrices.BasicDataWindowMaker.BasicDataWindow.arrow;
					colorCells  #mesquite.charMatrices.ColorByState.ColorByState;
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				endTell;
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				getEmployee #mesquite.charMatrices.AnnotPanel.AnnotPanel;
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				getEmployee #mesquite.charMatrices.QuickKeySelector.QuickKeySelector;
				tell It;
					autotabOff;
				endTell;
			endTell;
		endTell;
		endTell;
end;